امروز استفاده از انواع مایکروفر‌ها برای ما به نوعی سبک زندگی تبدیل شده و گرم کردن غذای از شب مانده برای ناهار امری کاملا عادی است اما محققان اعلام کرده‌اند که شما نمی توانید هر ماده‌ غذایی را در مایکروفر گرم یا طبخ کنید.
 کرفس، اسفناج
کلم، کرفس یا اسفناج یا هر نوع سبزی سبز برگ -به دلیل تجمع بالای نیترات در سبزی های برگ دار- وقتی گرم می شود ممکن است سمی شود.
قارچ
قارچ از جمله مواد غذایی است که باید به محض پخت تمام آن مصرف شود.زیرا قارچ شامل پروتئین است و پروتئین ها به محض برش خوردن فاسد می شود و برای معده ضرر دارد.
تخم‌مرغ
 گرم کردن تخم‌مرغ سبب تولید نوعی ماده سمی می‌شود که آسیب جدی به دستگاه گوارش وارد می کند. همچنین وقتی یک تخم مرغ آب پز داخل مایکروفر گذاشته می شود، رطوبت درون آن باعث ایجاد بخار آب بیش از حد می شود، درست مانند یک زودپز، تا نقطه ای که ممکن است تخم مرغ منفجر شود.
سیب‌زمینی
سیب زمینی از آن دسته مواد غذایی است که با این که ارزش غذایی زیادی دارد، اما با گرم کردن مجدد خواص غذایی خود را از دست می‌دهد حتی سمی می شود.
برنج
برنج نیمه آماده را در مایکروفر گرم نکنید. در مایکروفر قرار دادن برنج به سادگی می تواند باعث مسمومیت غذایی شود. برنج نپخته حاوی هاگ هایی از باکتری است که می تواند در فرایند گرم شدن زنده بماند.
مرغ
گرم کردن مرغ در مایکروفر و مصرف آن، می تواند مشکلات جدی گوارشی ایجاد کند. گرم کردن مرغ نیز مانند قارچ باعث تغییر ترکیب پروتئین درآن می شود. بنابراین توصیه می شود بادرجه حرارت پایین آن را گرم کنید.
پخت مرغ در مایکروفر:
گوشت تمام ماکیان از جمله مرغ، حاوی سالمونلاست. بنابراین ضروری است که گوشت آن را کاملا بپزید تا این باکتری ها از بین برود. مرغ تراکم پروتئین بالایی دارد و بسیار مهم است که پروتئین ها در دمایی یکسان بشکند.